ColectivoTF

CollecTF es una base de datos de sitios de unión de factores de transcripción en el dominio Bacteria. ^[1]

CollecTF recopila únicamente sitios de unión de TF validados experimentalmente. Esto se logra mediante la selección manual de literatura revisada por pares con un enfoque especial en el proceso experimental utilizado para identificar sitios de unión de TF.

Las entradas de CollecTF se envían periódicamente al NCBI para su integración en los registros completos del genoma de RefSeq como funciones de enlace externo, maximizando la visibilidad de los datos y enriqueciendo la anotación de los archivos de RefSeq con información regulatoria. Con el objetivo de facilitar la genómica comparativa y los análisis de aprendizaje automático de las interacciones regulatorias, en su versión inicial, CollecTF proporciona una cobertura de todo el dominio de dos familias de TF ( LexA y Fur ), así como una amplia representación de una familia bacteriana clínicamente importante, las Vibrionaceae .

• http://collectf.umbc.edu