Grupo 5

El clúster 5 es una designación utilizada por el Instituto Estatal Suero de Dinamarca para una variante del virus descrita por el instituto en otoño de 2020, en relación con las investigaciones de la infección por SARS-CoV-2 entre visones y humanos en el norte de Jutlandia , Dinamarca. ^{[ 1 ]}

El 3 de noviembre de 2020, el instituto presentó una evaluación de riesgos, en la que un experimento preliminar con esta variante del virus, descrito en una página y media, ^{[ 2 ]} sirvió de base para una evaluación sobre la eficacia de futuras vacunas contra la COVID-19. ^{[ 3 ]} Con referencia a esta evaluación de riesgos, el gobierno danés ordenó el 4 de noviembre de 2020 el sacrificio de todos los visones del país . ^{[ 4 ]} Se impuso un confinamiento con restricciones más estrictas en siete municipios del norte de Jutlandia.

En el momento en que se tomó la decisión de sacrificar a todos los visones daneses, la variante del virus se había detectado por última vez el 15 de septiembre de 2020. ^{[ 5 ] [ 6 ]} Tras las pruebas y secuenciación posteriores de las muestras positivas en los siete municipios del norte de Jutlandia, la fecha del último hallazgo seguía siendo el 15 de septiembre de 2020. ^{[ 7 ]} La Organización Mundial de la Salud escribió el 6 de noviembre de 2020, en referencia al experimento preliminar, que «Se requieren más estudios científicos y de laboratorio para verificar los hallazgos preliminares informados y para comprender cualquier posible implicación de este hallazgo en términos de diagnósticos, terapias y vacunas en desarrollo». ^{[ 8 ]}

Se solicitó a la Agencia Danesa de Medicamentos su evaluación de la variante del virus, un día después de que el gobierno decidiera sacrificar a todos los visones del país. ^{[ 9 ]} La agencia concluye en su evaluación que es poco probable que las mutaciones que caracterizan la variante del virus tengan un impacto sustancial en la eficacia de las vacunas de primera generación. ^{[ 10 ]}

En 2019, Dinamarca fue el mayor productor de piel de visón del mundo, ^{[ 11 ]} con la gran mayoría de las granjas danesas ubicadas en el norte y oeste de Jutlandia . ^{[ 12 ]} En los últimos años, la industria había estado en declive en general en el país. ^{[ 13 ]} Junto con los murciélagos, los pangolines y los humanos, los visones son una de las muchas especies de mamíferos que pueden infectarse con coronavirus . ^{[ 14 ]}

Aunque los científicos estaban descartando gradualmente el papel de los pangolines en la propagación de la COVID-19 , ^{[ 15 ] [ 16 ]} varios artículos afirmaron que las granjas de visones chinas podrían haber desempeñado un papel en la aparición de la COVID-19 . ^{[ 17 ] [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ] [ 21 ]} En colaboración con el periodista científico Yves Sciama, llevaron a cabo una investigación para Reporterre entre noviembre y diciembre de 2020. ^{[ 22 ] [ 23 ] [ 24 ]} Al día siguiente, la transmisión del virus de visones a humanos y las mutaciones relacionadas con los visones se documentaron en la revista Science , ^{[ 25 ]} lo que llevó al gobierno holandés a adelantar a finales de 2020 una prohibición de la cría de visones que estaba prevista para entrar en vigor en 2024. ^{[ 26 ]} Tras el descubrimiento en los Países Bajos, las autoridades de Dinamarca iniciaron un programa de vigilancia a gran escala de todas las granjas de visones del país, con pruebas y secuenciación genómica regulares. ^{[ 27 ]} Las secuencias de los virus relacionados con los visones daneses y holandeses se depositaron en la base de datos GISAID . ^{[ 28 ]} El Departamento de Agricultura de los Estados Unidos (USDA) confirmó que se habían documentado casos de visones enfermos con COVID-19 en Utah en agosto de 2020. ^{[ 29 ]} Se han detectado brotes adicionales en Michigan , Wisconsin y Oregón . ^{[ 30 ]} Hasta el 29 de noviembre de 2020, se han notificado infecciones por COVID-19 en visones en Dinamarca, Italia, los Países Bajos, España, Suecia y los Estados Unidos. ^{[ 31 ] [ 32 ]}

En Dinamarca, se han detectado cinco grupos de variantes de SARS-CoV-2 en visones; el Instituto Estatal Danés de Sueros (SSI) los ha designado como grupos 1-5 (en danés: grupo 1-5 ). En el grupo 5, también denominado ΔFVI - spike por el SSI, ^{[ 33 ]} se han confirmado varias mutaciones diferentes en la proteína de la espícula del virus. Las mutaciones específicas incluyen 69-70deltaHV (una deleción de los residuos de histidina y valina en las posiciones 69 y 70 de la proteína), Y453F (un cambio de tirosina a fenilalanina en la posición 453, dentro del dominio de unión al receptor de la proteína de la espícula), I692V ( isoleucina a valina en la posición 692), M1229I ( metionina a isoleucina en la posición 1229) y una sustitución no conservativa S1147L. ^{[ 34 ] [ 33 ] [ 1 ]}

En los Países Bajos se conocen mutaciones relacionadas con el visón que se asemejan parcialmente a las mutaciones descubiertas en Dinamarca, aunque forman parte de un grupo genómico distinto. ^{[ 25 ] [ 35 ]}

El 5 de noviembre, BBC News informó que se habían detectado 12 casos de infección humana con la variante del clúster 5. ^{[ 36 ]} Una semana después, un informe de evaluación rápida de riesgos del ECDC indicó que se habían producido 214 casos humanos relacionados con visones, ^{[ 35 ]} sin embargo, se cree que pocos de estos, si acaso alguno, fueron casos adicionales relacionados con el brote del clúster 5. ^{[ 37 ]} Para el 20 de noviembre, no se detectaron más casos humanos de la cepa del clúster 5 a pesar de la secuenciación genética generalizada que reveló 750 casos relacionados con visones, y se evaluó que la variante del clúster 5 ya no estaba circulando en humanos. ^{[ 38 ]}

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