Lista de herramientas de quimioinformática

Los kits de herramientas de quimioinformática son conjuntos de software de desarrollo que permiten a los quimioinformáticos crear aplicaciones informáticas personalizadas para su uso en cribado virtual, minería de bases de datos químicas y estudios de relación estructura-actividad. ^{[ 1 ] [ 2 ]} Estos kits se utilizan a menudo para experimentar con nuevas metodologías. Sus funciones más importantes se centran en la manipulación de estructuras químicas y la comparación entre ellas. Se proporciona acceso programático a las propiedades de los enlaces y átomos individuales.

Los kits de herramientas proporcionan la siguiente funcionalidad:

• Lee y guarda estructuras en varios formatos de archivo de química.
• Determinar si una estructura es una subestructura de otra (coincidencia de subestructuras).
• Determinar si dos estructuras son iguales (coincidencia exacta).
• Identificación de subestructuras comunes a las estructuras de un conjunto (subestructura común máxima, MCS).
• Descomponer las moléculas, dividiéndolas en fragmentos.
• Ensamblar moléculas a partir de elementos o submoléculas.
• Aplicar reacciones a las estructuras de los reactivos de entrada, obteniendo como resultado las estructuras de los productos de la reacción.
• Generación de huellas moleculares. Las huellas moleculares son vectores de bits donde cada bit corresponde a la presencia o ausencia de características estructurales. El uso más importante de las huellas moleculares es la indexación de bases de datos químicas.