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Articulo de referencia

CHD1L

La proteína 1 similar a la proteína de unión al ADN con dominio cromodominio-helicasa ( ALC1 ) es una enzima codificada en humanos por el gen CHD1L . [ 5 ] [ 6 ] Se ha implicado...

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La proteína 1 similar a la proteína de unión al ADN con dominio cromodominio-helicasa ( ALC1 ) es una enzima codificada en humanos por el gen CHD1L . [ 5 ] [ 6 ] Se ha implicado en la remodelación de la cromatina y en el proceso de relajación del ADN necesarios para la replicación, reparación y transcripción del ADN. La ALC1 consta de un dominio ATPasa y un macrodominio. Basándose en la homología dentro del dominio ATPasa, la ALC1 pertenece a la familia Snf2. [ 7 ]

Tiene 897 aminoácidos y un tamaño aproximado de 101 kDa. [ 8 ]

Función

En desarrollo

CHD1L, una helicasa de ADN , posee actividad de remodelación de la cromatina e interactúa con PARP1 /PARilación en la regulación de la pluripotencia durante la reprogramación del desarrollo . El macrodominio de CHD1L interactúa con la porción PAR de PARil-PARP1 para facilitar la reprogramación en etapa temprana y la pluripotencia en células madre. [ 9 ] Parece que la expresión de CHD1L es vital para los eventos tempranos en el desarrollo embrionario . [ 10 ] El papel de CHD1L en el desarrollo embrionario está relacionado con su función como activador transcripcional de varios genes (Akt, METP2, TCF4) que conducen a la EMT (transición epitelial a mesenquimal) [ 11 ] Cabe destacar que la EMT también está implicada en la metástasis tumoral, [ 12 ] lo que complica aún más el papel de CHD1L tanto en células sanas como enfermas.

En la reparación del ADN

Para permitir el proceso celular crítico de reparación del ADN, la cromatina debe ser remodelada en los sitios de daño. CHD1L (ALC1), una proteína de remodelación de la cromatina , actúa muy temprano en la reparación del ADN. La relajación de la cromatina ocurre rápidamente en el sitio de un daño en el ADN. [ 13 ] Este proceso es iniciado por la proteína PARP1 que comienza a aparecer en el daño del ADN en menos de un segundo, con una acumulación de la mitad del máximo dentro de 1,6 segundos después de que ocurre el daño. [ 14 ] PARP1 luego se PARila a sí misma, y ​​estas cadenas de PAR atraen el macrodominio de CHD1L, aliviando la autoinhibición y permitiendo que los dominios N-terminales interactúen con la cromatina. [ 15 ] El conector entre los dominios macro y N-terminal envuelve la histona, interactuando con el parche ácido del nucleosoma a través de un anclaje R611. [ 16 ] A continuación, el remodelador de cromatina CHD1L (ALC1) se une rápidamente al producto de PARP1 y completa su llegada al daño del ADN en 10 segundos desde el daño. [ 13 ] Aproximadamente la mitad de la relajación máxima de la cromatina, debido a la acción de CHD1L (ALC1), ocurre en 10 segundos. [ 13 ] Esto permite entonces el reclutamiento de la enzima de reparación del ADN MRE11 , para iniciar la reparación del ADN, en 13 segundos. [ 14 ] MRE11 está involucrada en la reparación por recombinación homóloga . CHD1L (ALC1) también es necesaria para la reparación de la cromatina dañada por UV a través de la reparación por escisión de nucleótidos . [ 17 ]

En el síndrome de deleción 1q21.1 se produce una alteración que provoca un aumento de las roturas del ADN. La función de CHD1L es similar a la de la helicasa en el síndrome de Werner [ 18 ].

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000131778 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000028089 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Mao M, Fu G, Wu JS, Zhang QH, Zhou J, Kan LX, Huang QH, He KL, Gu BW, Han ZG, Shen Y, Gu J, Yu YP, Xu SH, Wang YX, Chen SJ, Chen Z (julio de 1998). "Identificación de genes expresados ​​en células madre/progenitoras hematopoyéticas humanas CD34(+) mediante etiquetas de secuencia expresada y clonación eficiente de ADNc de longitud completa" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 95 (14): 8175–80 . Bibcode : 1998PNAS...95.8175M . doi : 10.1073 / pnas.95.14.8175 . PMC 20949. PMID 9653160 .  
  6. ↑ "Gen Entrez: proteína 1 similar a la proteína de unión al ADN helicasa con dominio cromodominio CHD1L" .
  7. ↑ Flaus A, Martin DM, Barton GJ, Owen-Hughes T (2006-05-31). "Identificación de múltiples subfamilias distintas de Snf2 con motivos estructurales conservados" . Nucleic Acids Research . 34 (10): 2887– 905. doi : 10.1093/nar/gkl295 . PMC 1474054. PMID 16738128 .  
  8. ↑ "UniProt" . UniProt .
  9. ↑ Jiang BH, Chen WY, Li HY, Chien Y, Chang WC, Hsieh PC, Wu P, Chen CY, Song HY, Chien CS, Sung YJ, Chiou SH (octubre de 2015). "Pluripotencia impulsada por PARP1 regulada por CHD1L y remodelación de la cromatina durante la reprogramación celular en etapa temprana" . Stem Cells . 33 (10): 2961–72 . doi : 10.1002/stem.2116 . PMC 4832376. PMID 26201266 .  
  10. ↑ Snider AC, Leong D, Wang QT, Wysocka J, Yao MW, Scott MP (febrero de 2013). "El factor de remodelación de la cromatina Chd1l es necesario en el embrión preimplantacional" . Biology Open . 2 (2): 121– 31. doi : 10.1242/bio.20122949 . PMC 3575647. PMID 23429299 .  
  11. ↑ Xiong, X.; Lai, X.; Li, A.; Liu, Z.; Ma, N. (2021). "Diversidad de funciones de CHD1L en la función celular normal y la tumorigénesis" . Biomarker Research . 9 (1): 16. doi : 10.1186/s40364-021-00269-w . PMC 7934534. PMID 33663617 .  
  12. ↑ Heerboth, S.; Housman, G.; Leary, M.; Longacre, M.; Byler, S.; Lapinska, K.; Willbanks, A.; Sarkar, S. (2015). "EMT y metástasis tumoral" . Medicina Clínica y Traslacional . 4 : 6. doi : 10.1186/ s40169-015-0048-3 . PMC 4385028. PMID 25852822 .  
  13. ^ Sellou H , Lebeaupin T, Chapuis C, Smith R, Hegele A, Singh HR, Kozlowski M, Bultmann S, Ladurner AG, Timinszky G, Huet S (diciembre de 2016). "El remodelador de cromatina Alc1 dependiente de poli (ADP-ribosa) induce la relajación local de la cromatina tras el daño del ADN" . Biología Molecular de la Célula . 27 (24): 3791– 3799. doi : 10.1091/mbc.E16-05-0269 . PMC 5170603 . PMID 27733626 .  
  14. 1 2 Haince JF, McDonald D, Rodrigue A, Déry U, Masson JY, Hendzel MJ, Poirier GG (enero de 2008). "Cinética dependiente de PARP1 del reclutamiento de las proteínas MRE11 y NBS1 a múltiples sitios de daño del ADN" . The Journal of Biological Chemistry . 283 (2): 1197– 208. doi : 10.1074/jbc.M706734200 . PMID 18025084 . 
  15. ↑ Wang, L.; Chen, K.; Chen, Z. (2021). "Base estructural de la autoinhibición de ALC1/CHD1L y el mecanismo de activación por el nucleosoma" . Nature Communications . 12 (1): 4057. doi : 10.1038/s41467-021-24320-4 . PMC 8249414. PMID 34210977 .  
  16. ↑ Lehmann, LC; Bacic, L.; Hewitt, G.; Brackmann, K.; Sabantsev, A.; Gaullier, G.; Pytharopoulou, S.; Degliesposti, G.; Okkenhaug, H.; Tan, S.; Costa, A.; Skehel, JM; Boulton, SJ; Deindl, S. (2020). " Perspectivas mecanicistas sobre la regulación del remodelador ALC1 por el parche ácido del nucleosoma" . Cell Reports . 33 (12). doi : 10.1016/j.celrep.2020.108529 . PMC 7116876. PMID 33357431 .  
  17. ^ Pines A, Vrouwe MG, Marteijn JA, Typas D, Luijsterburg MS, Cansoy M, Hensbergen P, Deelder A, de Groot A, Matsumoto S, Sugasawa K, Thoma N, Vermeulen W, Vrieling H, Mullenders L (octubre de 2012). "PARP1 promueve la reparación por escisión de nucleótidos mediante la estabilización de DDB2 y el reclutamiento de ALC1" . La revista de biología celular . 199 (2): 235– 49. doi : 10.1083/jcb.201112132 . PMC 3471223 . PMID 23045548 .  
  18. ↑ Harvard C (2011). " Comprender el impacto de la variante del número de copias 1q21.1" . Orphanet Journal of Rare Diseases . 6 : 54. doi : 10.1186/1750-1172-6-54 . PMC 3180300. PMID 21824431 .  

Lecturas adicionales

  • Matoba R, Okubo K, Hori N, Fukushima A, Matsubara K (septiembre de 1994). "La adición de información codificante 5' a una biblioteca de ADNc dirigida al 3' mejora el análisis de la expresión génica". Gene . 146 (2): 199–207 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90293-3 . PMID 8076819 . 
  • Maruyama K, Sugano S (enero de 1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de capuchón de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 . 
  • Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (octubre de 1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y en el extremo 5'". Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 . 
  • Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J, Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (octubre de 2000). "Clonación y análisis funcional de cDNAs con marcos de lectura abiertos para 300 genes previamente no definidos expresados ​​en células madre/progenitoras hematopoyéticas CD34+" . Genome Research . 10 ( 10): 1546– 60. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934. PMID 11042152 .  
  • Harrington JJ, Sherf B, Rundlett S, Jackson PD, Perry R, ​​Cain S, Leventhal C, Thornton M, Ramachandran R, Whittington J, Lerner L, Costanzo D, McElligott K, Boozer S, Mays R, Smith E, Veloso N, Klika A, Hess J, Cothren K, Lo K, Offenbacher J, Danzig J, Ducar M (mayo de 2001). "Creación de bibliotecas de expresión de proteínas a nivel genómico mediante activación aleatoria de la expresión génica". Nature Biotechnology . 19 (5): 440– 5. doi : 10.1038/88107 . PMID 11329013. S2CID 25064683 .  
  • Karras GI, Kustatscher G, Buhecha HR, Allen MD, Pugieux C, Sait F, Bycroft M, Ladurner AG (junio de 2005). "El macrodominio es un módulo de unión a ADP-ribosa" . The EMBO Journal . 24 (11): 1911–20 . doi : 10.1038/sj.emboj.7600664 . PMC 1142602. PMID 15902274 .  
  • Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T, Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (enero de 2006). "Diversificación de la modulación transcripcional: identificación y caracterización a gran escala de supuestos promotores alternativos de genes humanos" . Investigación del genoma . 16 (1): 55– 65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .