Articulo de referencia

CCR4-No

Estructura del módulo humano CNOT1-CNOT2-CNOT3 (PDB 4C0D). [ 1 ] El complejo CCR4 - Not , o CCR4-Not , es un complejo multiproteico que funciona en la expresión génica. [ 2 ] [ ...

Estructura del módulo humano CNOT1-CNOT2-CNOT3 (PDB 4C0D). [ 1 ]

El complejo CCR4 - Not , o CCR4-Not , es un complejo multiproteico que funciona en la expresión génica. [ 2 ] [ 3 ] El complejo tiene múltiples actividades enzimáticas como exonucleasa de poli(A) 3′- 5 ′ y ubiquitina ligasa . [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] La actividad exonucleasa de CCR4-Not acorta la cola de poli(A) que se encuentra en el extremo 3' de casi todos los ARNm eucariotas. [ 8 ] El complejo está presente tanto en el núcleo , donde regula la transcripción, como en el citoplasma , donde se asocia con los ribosomas traductores y los cuerpos de procesamiento de ARN . [ 2 ] [ 3 ] En las células de mamíferos, tiene una función en la regulación del ciclo celular, modificación de la cromatina, activación e inhibición de la iniciación de la transcripción, control de la elongación de la transcripción, exportación de ARN, vigilancia del ARN nuclear y reparación del daño del ADN en el núcleo. El complejo Ccr4–Not desempeña un papel importante en la degradación del ARNm y el control de calidad de las proteínas en el citoplasma. [ 9 ]

Subunidades

El complejo CCR4-Not humano está compuesto por subunidades estructurales (no catalíticas) y aquellas que poseen actividad exonucleasa y ligasa E3 . Algunas, pero no todas, las subunidades humanas se conservan en la levadura de gemación . [ 10 ] En la levadura, el complejo tiene nueve subunidades centrales, que comprenden Ccr4 (represión catabólica de carbono), proteínas Caf (factor asociado a Ccr4) (Caf1, Caf40, Caf130) y proteínas Not (Not1, Not2, Not3, Not4 y Not5). [ 11 ]

Peso molecular de las subunidades humanas según Uniprot.

Véase también

Referencias

  1. Boland, Andreas; Chen, Ying; Raisch, Tobias; Jonas, Stefanie; Kuzuoğlu-Öztürk, Duygu; Wohlbold, Lara; Weichenrieder, Oliver; Izaurralde, Elisa (2013-10-13). "Estructura y ensamblaje del módulo NOT del complejo CCR4–NOT humano". Nature Structural & Molecular Biology . 20 (11). Springer Science and Business Media LLC: 1289– 1297. doi : 10.1038/nsmb.2681 . ISSN 1545-9993 . PMID 24121232 . S2CID 24288483 .   
  2. 1 2 Collart, Martine A. (2016-01-29). "El complejo Ccr4-Not es un regulador clave de la expresión génica eucariota" . Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA . 7 (4). Wiley: 438– 454. doi : 10.1002/wrna.1332 . ISSN 1757-7004 . PMC 5066686. PMID 26821858 .   
  3. 1 2 Miller, Jason E.; Reese, Joseph C. (2012-03-15). "Ccr4-Not complex: the control freak of eukaryotic cells" . Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology . 47 (4). Informa UK Limited: 315–333 . doi : 10.3109/10409238.2012.667214 . ISSN 1040-9238 . PMC 3376659. PMID 22416820 .   
  4. 1 2 3 Aslam, Akhmed; Mittal, Saloni; Koch, Frederic; Andrau, Jean-Christophe; Winkler, G. Sebastiaan (2009). Wickens, Marvin (ed.). "Las subunidades CNOT7 y CNOT8 de la desadenilación Ccr4–Not tienen funciones superpuestas y modulan la proliferación celular" . Biología molecular de la célula . 20 (17). Sociedad Americana de Biología Celular (ASCB): 3840–3850 . doi : 10.1091/mbc.e09-02-0146 . ISSN 1059-1524 . PMC 2735483. PMID 19605561 .   
  5. 1 2 Chen J, Chiang YC, Denis CL (marzo de 2002). "CCR4, una exonucleasa de ARN poli(A) y ADN monocatenario 3′-5′, es el componente catalítico de la deadenilasa citoplasmática" . EMBO J. 21 ( 6): 1414–26 . doi : 10.1093/ emboj /21.6.1414 . PMC 125924. PMID 11889047 .  
  6. "Gen Entrez: complejo de transcripción CNOT6 CCR4-NOT, subunidad 6" .
  7. ^ Albert , Thomas K.; Hanzawa, Hiroyuki; Legtenberg, Yvonne IA; de Ruwe, Marjolein J.; van den Heuvel, Fiona AJ; Collart, Martine A.; Boelens, Rolf; Timmers, HTh Marc (1 de febrero de 2002). "Identificación de una subunidad ubiquitina-proteína ligasa dentro del complejo represor de la transcripción CCR4-NOT" . La Revista EMBO . 21 (3). Wiley: 355– 364. doi : 10.1093/emboj/21.3.355 . ISSN 0261-4189 . PMC 125831 . PMID 11823428 .   
  8. Stowell, James AW; Webster, Michael W.; Kögel, Alexander; Wolf, Jana; Shelley, Kathryn L.; Passmore, Lori A. (2016-11-15). "Reconstitución de la desadenilación dirigida por el complejo Ccr4-Not y la proteína Mmi1 del dominio YTH" . Cell Reports . 17 (8): 1978– 1989. doi : 10.1016/j.celrep.2016.10.066 . ISSN 2211-1247 . PMC 5120349. PMID 27851962 .   
  9. Chalabi Hagkarim, Nafiseh; Grand, Roger J. (2020-10-29). " Las propiedades reguladoras del complejo Ccr4–Not" . Cells . 9 (11): 2379. doi : 10.3390/cells9112379 . ISSN 2073-4409 . PMC 7692201. PMID 33138308 .   
  10. Albert, TK (1 de febrero de 2000). "Aislamiento y caracterización de ortólogos humanos de subunidades del complejo CCR4-NOT de levadura" . Nucleic Acids Research . 28 (3). Oxford University Press (OUP): 809–817 . doi : 10.1093/nar/28.3.809 . ISSN 1362-4962 . PMC 102560. PMID 10637334 .   
  11. Collart, Martine A (2003-08-14). "Control global de la expresión génica en levaduras por el complejo Ccr4-Not" . Gene . 313 : 1–16 . doi : 10.1016/S0378-1119(03)00672-3 . ISSN 0378-1119 . PMID 12957374 .  
  12. 1 2 3 Zheng, Xiaofeng; Dumitru, Raluca; Lackford, Brad L.; Freudenberg, Johannes M.; Singh, Ajeet P.; Archer, Trevor K.; Jothi, Raja; Hu, Guang (2012-04-09). "Cnot1, Cnot2 y Cnot3 mantienen la identidad de las células madre embrionarias de ratón y humanas e inhiben la diferenciación extraembrionaria" . Stem Cells . 30 (5). Wiley: 910– 922. doi : 10.1002/stem.1070 . ISSN 1066-5099 . PMC 3787717. PMID 22367759 .   
  13. Hu, G.; Kim, J.; Xu, Q.; Leng, Y.; Orkin, SH; Elledge, SJ (2009-04-01). "Un análisis de ARN de interferencia a nivel genómico identifica un nuevo módulo transcripcional necesario para la autorrenovación" . Genes & Development . 23 (7). Cold Spring Harbor Laboratory: 837– 848. doi : 10.1101 / gad.1769609 . ISSN 0890-9369 . PMC 2666338. PMID 19339689 .   
  14. Pavanello, Lorenzo; Hall, Benjamin; Airhihen, Blessing; Winkler, Gerlof Sebastiaan (2018-11-09). "La región central de CNOT1 y CNOT9 estimula la desadenilación por el módulo nucleasa Ccr4–Not" . Biochemical Journal . 475 (21). Portland Press Ltd.: 3437–3450 . doi : 10.1042/bcj20180456 . ISSN 0264-6021 . PMID 30309886. S2CID 52962278 .   
  15. 1 2 Mauxion, Fabienne; Prève, Brigitte; Séraphin, Bertrand (2013). "C2ORF29/CNOT11 y CNOT10 forman un nuevo módulo del complejo CCR4-NOT" . RNA Biology . 10 (2). Informa UK Limited: 267–276 . doi : 10.4161/rna.23065 . ISSN 1547-6286 . PMC 3594285. PMID 23232451 .