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Articulo de referencia

Atribacterota

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Atribacterota es un filo de bacterias , que son comunes en sedimentos anóxicos ricos en metano . Están distribuidos mundialmente y en algunos casos son abundantes en sedimentos marinos anaeróbicos , manantiales geotérmicos y depósitos de petróleo . Los análisis genéticos sugieren un metabolismo heterótrofo que da lugar a productos de fermentación como acetato , etanol y CO₂ . Estos productos a su vez pueden sustentar a los metanógenos dentro de la comunidad microbiana del sedimento y explican la frecuente presencia de Atribacterota en sedimentos anóxicos ricos en metano. [ 2 ] [ 3 ] Según el análisis filogenético, Atribacterota parece estar relacionado con varios filos termófilos dentro de Pseudomonadati . [ 4 ] Según la investigación, Atribacterota muestra patrones de expresión genética que consisten en metabolismo fermentativo y acetogénico. Estas expresiones permiten a Atribacterota crear funciones catabólicas y anabólicas necesarias para la reproducción celular, incluso cuando los niveles de energía son limitados debido al agotamiento del oxígeno disuelto en aguas marinas, dulces o subterráneas. [ 5 ]

Clasificación

Filogenia

Taxonomía

La taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) [ 9 ] y la Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) [ 10 ] se utilizaron como autoridad taxonómica principal para establecer las prioridades de nomenclatura. También se consultó el sitio web de Annotree [ 11 ] , que utiliza la versión 06-RS202 de GTDB [ 12 ] .

  • " Clase Phoenicimicrobiia " Jiao et al. 2024 [JS1]
    • Orden "Phoenicimicrobianos" Jiao et al. 2024 [SB-45]
      • Familia "Stramentimicrobiaceae" Jiao et al. 2024
      • Familia "Phoenicimicrobiaceae" Jiao et al. 2024 [34-128]
  • Clase Atribacteria Katayama et al. 2021
    • Orden Atribacterales Katayama et al. 2021
      • Familia Atrimonadaceae Kawamoto et al. 2024
      • Familia Thermatribacteraceae Jiao et al. 2024
      • Familia Atribacteraceae Katayama et al. 2021 (OP9)
      • Familia "Caldatribacteriaceae"

Véase también

Referencias

  1. ↑ Oren A, Garrity GM (2021). "Publicación válida de los nombres de cuarenta y dos filos de procariotas" . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID 34694987. S2CID 239887308 .  
  2. ↑ Nobu, MK, Dodsworth, JA, Murugapiran, SK, Rinke, C., Gies, EA, Webster, G., ... & Jørgensen, BB (2016) Filogenia y fisiología del filo candidato 'Atribacteria' (OP9/JS1) inferidas a partir de genómica independiente del cultivo . The ISME journal, 10(2), 273-286.
  3. ↑ Carr, SA, Orcutt, BN, Mandernack, KW y Spear, JR (2015). Abundantes Atribacterias en sedimentos marinos profundos de la cuenca de Adelia, Antártida . Fronteras en microbiología, 6.
  4. ↑ Göker, Markus; Oren, Aharon (2024). "Publicación válida de nombres de dos dominios y siete reinos de procariotas" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 74 (1): 006242. doi : 10.1099/ijsem.0.006242 . ISSN 1466-5034 . PMID 38252124 .  
  5. ↑ Vuillemin, Aurèle; Vargas, Sergio; Coskun, Ömer K.; Pockalny, Robert; Murray, Richard W.; Smith, David C.; D'Hondt, Steven; Orsi, William D. (2020-07-11). "Atribacteria reproduciéndose durante millones de años en el subsuelo abisal del Atlántico" . mBio . 11 ( 5). bioRxiv 10.1101/2020.07.10.198200 . doi : 10.1128/mbio.01937-20 . PMC 7542362. PMID 33024037 .   
  6. ↑ "GTDB versión 10-RS226" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
  7. ↑ "bac120_r226.sp_label" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
  8. ↑ "Historial de taxones" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
  9. ↑ Sayers; et al. "Atribacterota" . Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 20 de marzo de 2021 . 
  10. ↑ JP Euzéby. "Atribacterota" . Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 27 de junio de 2021 .
  11. ↑ Mendler, K; Chen, H; Parks, DH; Hug, LA; Doxey, AC (2019). "AnnoTree: visualización y exploración de un árbol de la vida microbiano anotado funcionalmente" . Nucleic Acids Research . 47 (9): 4442– 4448. doi : 10.1093/nar/gkz246 . PMC 6511854. PMID 31081040. Archivado del original el 23 de abril de 2021. Recuperado el 15 de julio de 2021 .  
  12. ↑ "GTDB versión 06-RS202" . Base de datos de taxonomía del genoma .
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