Addgene

Addgene es un repositorio de plásmidos sin ánimo de lucro . Facilita el intercambio de material genético entre laboratorios, ofreciendo plásmidos y sus datos de clonación asociados a laboratorios académicos y sin ánimo de lucro de todo el mundo. Addgene proporciona una base de datos en línea gratuita con información y referencias sobre clonación de plásmidos, incluyendo listas de vectores de uso común, plásmidos lentivirales populares y protocolos de clonación molecular .

Addgene fue fundada en 2004 por Melina Fan, Kenneth Fan y Benjie Chen. ^{[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]} El repositorio se fundó en reconocimiento de la necesidad de un servicio que apoyara el acceso y el intercambio de materiales de investigación basados ​​en ADN entre la comunidad científica. ^{[ 3 ]}

La sede central de Addgene se encuentra en Watertown, Massachusetts .

Addgene acepta plásmidos de investigadores, los archiva y los distribuye bajo petición.

La organización cubre los costos operativos de mantenimiento y mejora de la colección cobrando una tarifa nominal a los científicos que solicitan plásmidos. ^{[ 4 ] [ 5 ]}

En 2014, el repositorio de Addgene comprendía 30 000 plásmidos, depositados por 1700 laboratorios. ^{[ 6 ]} En 2024, la colección había crecido hasta alcanzar más de 147 000 plásmidos y había proporcionado servicios a más de 2 millones de vectores en más de 110 países diferentes. ^{[ 3 ]} Su colección de plásmidos contiene plásmidos utilizados para funciones como la ingeniería genómica (incluido CRISPR), la expresión génica , la inactivación génica mediante shRNA , la administración génica mediada por virus, la detección de miRNA y la actividad promotora. La colección de plásmidos incluye:

• Ingeniería genómica
  • CRISPR
  • Kits de nucleasas efectoras tipo activador de la transcripción (TALEN)
  • kits de nucleasas de dedos de zinc
• Columnas vertebrales vacías
  • expresión específica de la especie
  • Etiquetas de epítopos
  • Proteínas de fusión
  • Marcadores seleccionables
  • Marcador fluorescente
• Vectores virales
  • Retroviral/Lentiviral
  • Adenovirus
  • AAV
• expresión de ADNc
• expresión de shRNA

Herramientas de biología molecular

Base de datos de vectores : una lista seleccionada de más de 4000 estructuras base de vectores, que incluye información relevante sobre clonación y condiciones de crecimiento bacteriano.

Sequence Analyzer : una herramienta de software de Addgene para crear mapas de plásmidos a partir de secuencias con características anotadas y sitios de restricción.

Referencia de Biología Molecular : una colección de referencias sobre reactivos de biología molecular, como cebadores, enzimas de restricción y concentraciones de antibióticos.

Guías para la clonación de plásmidos

Guías de clonación molecular : materiales de referencia para ayudar a los científicos a diseñar experimentos de clonación de plásmidos, incluyendo tutoriales sobre digestión con enzimas de restricción y clonación basada en PCR.

Protocolos de clonación molecular : protocolos específicos para diversas técnicas de clonación de plásmidos, como el aislamiento de colonias bacterianas, la purificación de ADN mediante electroforesis en gel y la transformación bacteriana.

Addgene colabora con institutos y consorcios para gestionar colecciones de plásmidos con fines específicos. Algunos ejemplos de estas colaboraciones son las colecciones especiales del Consorcio de Genómica Estructural , el Consorcio de Dedos de Zinc, el Consorcio de Migración Celular, la colección KLF y la Fundación Michael J. Fox . ^{[ 7 ]} Los plásmidos están disponibles tanto para laboratorios académicos como industriales.

En 2020, Addgene recibió financiación de Fast Grants para subvencionar el coste de los reactivos para la investigación de la COVID-19 . ^{[ 8 ]}

Entre los depositantes más destacados se encuentran:

• 13 premios Nobel: John Gurdon , Shinya Yamanaka , Bruce Beutler , Mario Capecchi , Andrew Fire , Richard Axel , Eric Wieschaus , Phillip Sharp , Robert Lefkowitz , Martin Chalfie , Roger Tsien , Jennifer Doudna y Johann Deisenhofer .
• 8 ganadores del Premio Breakthrough en Ciencias de la Vida; Cori Bargmann , David Botstein , Lewis C. Cantley , Hans Clevers , Titia de Lange , Bert Vogelstein , Robert Weinberg y Shinya Yamanaka .

Addgene exige Acuerdos de Transferencia de Materiales (MTA) para todos los materiales transferidos a través de Addgene con el fin de proteger la propiedad intelectual de los depositantes de plásmidos. Addgene desarrolló uno de los primeros sistemas electrónicos para gestionar los MTA. ^{[ 9 ]} Mediante el uso del Acuerdo Universal de Transferencia de Material Biológico (UBMTA) estándar y la implementación de firmas electrónicas, el sistema de MTA electrónico (eMTA) de Addgene agiliza el proceso de aprobación de los pedidos de plásmidos.

Addgene ganó premios por innovación e investigación, incluyendo el Premio Mass Nonprofit Network a la excelencia en innovaciones, ^{[ 10 ] [ 11 ]} el Premio del programa de premios de Cambridge 2014 para laboratorios de investigación y desarrollo, ^{[ 12 ]} Finalista del Premio Mass Technology Leadership 2012. ^{[ 13 ]}

• Sitio web oficial