3 lo hizo

La base de datos de dominios interactuantes tridimensionales ( 3did ) es una base de datos biológica que contiene un catálogo de interacciones proteína-proteína para las cuales se conoce una estructura 3D de alta resolución. ^{[ 1 ]} 3did recopila y clasifica todos los modelos estructurales de interacciones dominio-dominio en el Protein Data Bank , proporcionando detalles moleculares para dichas interacciones. 3did utiliza la base de datos Pfam para definir la posición de los dominios proteicos en las estructuras proteicas. 3did se publicó por primera vez en 2005. ^{[ 2 ]} La versión actual también incluye un flujo de trabajo para el descubrimiento y la anotación de nuevas interacciones dominio-motivo. Para cada interacción, 3did identifica y agrupa diferentes modos de unión agrupando interfaces similares en "topologías de interacción". Al mantener una colección constantemente actualizada de plantillas de interacción estructural basadas en dominios, 3did es una fuente de información de referencia para la caracterización estructural de redes de interacción proteica. 3did se actualiza cada seis meses y está disponible para descarga masiva y para consulta en http://3did.irbbarcelona.org . ^{[ 3 ]}

Véase también

Referencias

1 2 Stein, Amelie; Céol Arnaud; Aloy Patrick (enero de 2011). "3did: identificación y clasificación de interacciones basadas en dominios de estructuras tridimensionales conocidas" . Nucleic Acids Res . 39 (número especial de bases de datos). Inglaterra: D718–23. doi : 10.1093/nar/gkq962 . PMC 3013799. PMID 20965963 .
↑ Stein, A; Russell, RB; Aloy, P (2005). "3did: dominios proteicos interactuantes de estructura tridimensional conocida" . Nucleic Acids Research . 33 (número de base de datos): D413–7. doi : 10.1093/nar/gki037 . PMC 539991. PMID 15608228 .
↑ Mosca, R; Céol, A; Stein, A; Olivella, R; Aloy, P (2014). "3did: Un catálogo de interacciones basadas en dominios de estructuras tridimensionales conocidas" . Nucleic Acids Research . 42 (número especial de bases de datos): D374–9. doi : 10.1093/nar/gkt887 . PMC 3965002. PMID 24081580 .

Enlaces externos

http://3did.irbbarcelona.org

[Stein-1] 1 2 Stein, Amelie; Céol Arnaud; Aloy Patrick (enero de 2011). "3did: identificación y clasificación de interacciones basadas en dominios de estructuras tridimensionales conocidas" . Nucleic Acids Res . 39 (número especial de bases de datos). Inglaterra: D718–23. doi : 10.1093/nar/gkq962 . PMC 3013799. PMID 20965963 .

[2] Stein, A; Russell, RB; Aloy, P (2005). "3did: dominios proteicos interactuantes de estructura tridimensional conocida" . Nucleic Acids Research . 33 (número de base de datos): D413–7. doi : 10.1093/nar/gki037 . PMC 539991. PMID 15608228 .

[3] Mosca, R; Céol, A; Stein, A; Olivella, R; Aloy, P (2014). "3did: Un catálogo de interacciones basadas en dominios de estructuras tridimensionales conocidas" . Nucleic Acids Research . 42 (número especial de bases de datos): D374–9. doi : 10.1093/nar/gkt887 . PMC 3965002. PMID 24081580 .

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